Fudbalski klub Krupa posvećuje veliku pažnju svojim mlađim kategorijama koje su važan dio ovog kluba. Omladinska škola broji oko 100 fudbalera u selekcijama U-19, U-17 i U-15 sa kojima rade kvalitetni treneri i koje se takmiče u Omladinskim ligama Bosne i Hercegovine. Pored takmičarskih mečeva, mlađe kategorije kluba takođe učestvuju na domaćim i međunarodnim turnirima. Mladi fudbaleri Krupe kao i prvi tim našeg kluba imaju odlične uslove za treniranje. Važno je napomenuti da je članarina besplatna u svim kategorijama, što Omladinsku školu FK Krupe čini jedinstvenom u BiH. Cilj naše Omladinske škole pored fudbalskog razvoja, jeste obezbjediti uslove za rad i pružiti mogućnosti svakom djetetu podrške, motivacije, usmjerenja prema talentu"

Direktor Omladinske škole FK Krupa: Velimir Stojnić
Trener Juniora: Nenad Studen
Trener Kadeta: Nikola Vidović
Trener Pionira: Veljko Lolić
Trener Predpionira: Marko Erak